Bioinformatique évolutive – Application aux systèmes CRISPR-Cas9
La bioinformatique a joué un rôle essentiel, depuis l'obtention des premières séquences de protéines, dans le décodage, l'analyse, la classification de l'information génétique et la compréhension des phénomènes biologiques sous-jacents. En parallèle, la découverte d'enzymes permettant de couper et coller des fragments spécifiques d'ADN a permis de modifier la structure génétique des organismes vivants, ce qui a donné naissance à l'industrie de la biotechnologie. En particulier, l'une des inventions majeures de ces dernières années est la technologie CRISPR-Cas9 issue d'un système immunitaire microbien permettant de lutter contre les virus. CRISPR-Cas9 est actuellement l'un des "ciseaux moléculaires" les plus fiables et les plus précis en biotechnologie. La bioinformatique a joué un rôle essentiel dans toutes les étapes de détection, d'analyse, de classification des systèmes CRISPR. Dans cette présentation, j'utiliserai ce système biologique comme exemple pour dresser un tableau des problématiques bioinformatiques sous-jacentes, et je parlerai notamment des méthodes algorithmiques développées dans mon laboratoire pour étudier l'évolution des modules de gènes Cas, par duplication, pertes et transferts horizontaux.
Conférencière : Nadia El-Mabrouk
Professeure titulaire au DIRO et membre du Centre de Recherche Mathématiques et du Centre Robert Cedergren. Son expertise de recherche est en bio-informatique, et notamment dans le domaine de la phylogénie et de la génomique comparative. Elle est impliquée, chaque année, dans le comité de programme des conférences les plus populaires en biologie computationnelle telles que ISMB/ECCB ou RECOMB. Elle a été coprésidente du comité de programme de ISMB en 2018 et 2019. Elle a organisé deux ateliers RECOMB Comparative Genomics à Montréal. Ses recherches paraissent dans une variété de revues d'informatique, de bioinformatique et de sciences de la vie, telles que Bioinformatics, Molecular Biology and Evolution, Nature Scientific Reports, Systematic Biology ou Theoretical Computer Science.
DÉROULEMENT DE LA SOIRÉE
Mercredi 2 novembre 2022
- 17:00 : Accueil
- 18:00 : Assemblée générale, S1-125 du Pavillon Jean-Coutu (diplômés seulement)
- 18:30 : Buffet, Agora du Pavillon Jean-Coutu (inscription obligatoire)
- 19:30 : Début de la conférence, S1-151 du Pavillon Jean-Coutu (admission générale)
Inscription
Vous pouvez vous inscrire pour l'AGA et le buffet: Soirée RETROUVAILLES - 2 NOVEMBRE 2022
La conférence est gratuite - admission générale.
Si vous souhaitez vous impliquer dans l'association et vous présenter comme membre du conseil, veuillez contacter Sylvie Hamel (hamelsyl@iro.umontreal.ca), directrice du DIRO et responsable du comité de nomination.
